20 Episodes của Season 1 đã hứa hẹn cho chúng ta 1 Season 2 hay ko kém,khi mà tất cả mọi chuyện mới là sự khởi đầu. Trong Season 1 bộ 3 Olivia,Peter và Walter đã phải đối đầu với những sự kiện hết sức quái dị,nào là các căn bệnh và vi-rút cực hiếm,các khả năng tâm linh kì lạ của con người hay transhuman,teleportation,... Và đặc biệt là việc khám phá ra các thế giới song song ở tập 20! Cho dù là gì nhưng tất cả đầu mối đều dẫn đến "The Patte",và dẫn đến cuộc đối đầu giữa tập đoàn hàng đầu thế giới Massive Dynamics và tổ chức khủng bố ZFT. Rốt cuộc thì ai là người tốt,và ai là kẻ xấu ? Olivia và những người khác liệu có phải chỉ là quân cờ hay họ sẽ thay đổi được cục diện trận đấu này ?