Kỷ nguyên vũ trụ - Cosmic Era (CE) 70, Thảm kịch "Bloody Valentine" đã leo thang thành một cuộc chiến giữa Liên Minh Trái Đất và ZAFT. Cuộc chiến ngày càng trở nên nghiêm trọng. Khiến rất nhiều sinh mạng phải hy sinh, họ đã đạt được thỏa thuận ngừng bắn sau cuộc chiến thứ hai ở Yakin Do. Tuy nhiên, thỏa thuận ngừng bắn đã không hoàn toàn khắc phục được xung đột giữa Naturals và Coordinators.

Trong suốt cuộc chiến, Shinn Asuka đã tham gia vào Liên Minh Trái Đất để thâm nhập vào Orb. Trong lúc thoát khỏi đám cháy, cậu ta đã mất cha mẹ và chứng kiến cái chết của em gái trước mắt mình, khi cậu ta đang nắm chặt điện thoại của em gái mình và chìm sâu trong nỗi đau đớn, một gundam, là nguyên nhân chính của cuộc chiến tranh, đang bay bên trên cậu ấy. Cảm thấy tuyệt vọng, cậu ta rời Orb và đến PLANT.