Câu chuyện của Cooties (virus bí ẩn) xảy ra tại một trường tiểu học nhỏ, nơi mà cuộc sống hằng ngày của cả giáo viên và học sinh ở đây đã bị đảo lộn sau một sự kiện bi thảm. Sự kiện này bắt đầu khi các học sinh của trường bị nhiễm một loại virus lạ, biến đổi chúng thành những sinh vật vô cùng hung hãn. Những học sinh này đã tấn công bạn bè của mình và thậm chí cả các giáo viên cũng là nạn nhân của những vụ tấn công này. Một anh chàng giáo viên hiền lành ... vô dụng sẽ phải đứng lên và lãnh đạo những thầy cô khác chiến đấu chống lại những sinh vật kì lạ này để giành giật lấy sự sống.